<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01//EN"
 "http://www.w3.org/TR/html4/strict.dtd">
<html lang="en-US">
  <head>
    <title>Visualize homology</title>
    <meta http-equiv="Content-Type" content ="text/html; charset=utf-8">
    <link rel="stylesheet" href="../visblaststylejw.css" type="text/css">
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMM Jason Weirather (2010) MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNMMMMMMMMMho+hNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMNNNMMMMMMMNo+-ooo+hdhyyhhhdMMMMMMMMMMMMNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMNNMMMNNddddddhdNhso+/.`  .:/o+~~-:/oo/oyhNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMNhyyyhso/oo+o/-+o/.``       -`` ` `     ``/yddmmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMNdsoooo+/.+oo+-..+:.                        .:.-:odNmNMNNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMmysoo+oo/`-:-/o+/.``:/                        `    `+ysyNNMNNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMmyoo++:.++` `  ```     `                              `:+oyMMhmNNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMyooooo//+`                                              `/oNNmNmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MNMMhsoooooo:`    `                                           /shdmysdNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MNmdyoooooo+-                                                -+/oosooyNmhmNMNMNNNMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--Mmdsoooooooo/`                                               ```:/oosyoooshNdmddNNMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--Mmhssooooo+o+`                                                 -.`./oo:/oosdhhshMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MNdyoooooo+oo```                                                   -++:+osysoosmMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--mddsoooooooo++-` `                                                  `-+oshmyshmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--mhhooooooo+/:-``                                                      +ossdmNNNmhhMMMNMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--Nhsoooooooooo-                                                        /+/:/::/+osmmhymmMMMMMMMMMMMMM-->
<!--hooooooooo++/.                                                         `      `-+ssohNMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ysoooooooo/+-`                                                                   .:+ohdNMMMMMMMMMMMM-->
<!--soooooooo+.`                                                                       `/osyNMMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooo+:~~                                                                        .oooosNMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooo+`                                                                         .:+oooodMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo:`.`                                                                       oooooosMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo/-/.                                                                       -ooooooMMMMMMMMMM-->
<!--ooooo+ooo`.`                                                                     ``-oooooyMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooooo+/.                                                                    .:++oooooyMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo+-   ````:-/:~~`````                                                     `/oooooodMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooo+- `.:/soshhhso+o+//:`.`                                                   :o+ooosMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooo+..:syssyosoo//o++++oso+/:~~.``                                             `.:ooohMMMMMMMMMMM-->
<!--ooooo++oyhsoo+/-..    `.-:/o+syhddso+/-`                                            `/oodMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooossoo+/:`            ````:osdmmNMNh+-.`                                        `+ooyMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooo/.`.`              ````.`.-+osyddmdyo+:                                      `.+oosNMMMMMMMMMM-->
<!--oooooo.   ``  .`..-::/o+++osoooosssoooooso+/-  -                         `..~~`-//++osdmhmMMMMMMMMMM-->
<!--oooooo+:./oo++ooossysdNNhyooyyoooossoooooo::-``.                    `.::/osydmdddddNNMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooooooooooohmMmo:/mMMMNMMN+yyooooooooooo+/.                 `:+ydNNMMMMNNNddddmNMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooooooooymms+`  hMMMNhMMN: `:+oooooooooo+                 -+hNNNNmmdmysooo++/+ssydMMMMMMMMMMMMM-->
<!--::+oooooooooooosso:` :NMMMMMNh`    `:+/:///oo+:              .+oydysssyddNyydmdhssooooohMMMMMMMMMMMM-->
<!--/  -ooooooooooooooo+-`.sddhs:`  ``.-::/    +o:.             -oo+::+mMMmNMMN. .+mMNdysoodMMMMMMMMMMMM-->
<!---  .oooooooooooooooooo+:/-` .`.:+:+/+/-.  `o/               -oo+/`.mmMmNMMM-  `ymMMMhohNMMMMMMMMMMMM-->
<!--  ``/:~~-:/oooooooooooooo///+/:/:/oo+-   ./+-               +oooo+-+dmMMMNo  .s+mMMmyyMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--`:`        `-/ooooooooooooo+/o//+/:.` ``~~.                 /oooo+:-://so-.-:+ydMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--             `-/.-`-.~~-:...-::.``.  ``-:``   `             -ooooooooooooooodmMMMMMMdymMMMMMMMMMMMMM-->
<!--               ...`       `````          /:                 :ooooooooooooooosymMNmmhooyMMMMMMMMMMMMM-->
<!--                                                            :ooooooooooooooooooysoysoosNMMMMMMMMMMMM-->
<!--                                                            :ooooooooooooooooooooooooosMMMMMMMMMMMMM-->
<!--                                                            -oooo+`:+ooooooooooooooooooNMMMMMMMMMMMM-->
<!--                                                            .ooooo- `:/ooooooooooooooosMMMMMMMMMMMMM-->
<!--                                                            .oooo+`    `-/++oooooooooooNMMMMMMMMMMMM-->
<!---                                                           `ooooo.       ```-/.`:oooosMMMMMMMMMMMMM-->
<!--o-`                                  .``:-/.                 +ooo:`            ..-:ooohMMMMMMMMMMMMM-->
<!--/-`                                `:+:-```                 :oooo.`              :ooooNMMMMMMMMMMMMM-->
<!--/+.`                      ``       /o/                      `-ooo+:              -oooyMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--o+/+/-.`                ``.`       :o-                       -oooo/.`            /ooyMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oo/+/o+` `           `++-          `+/`                      -oooo-+`          `:oosNMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oo+-.:~~             ```            `/+/.```````             :oooo.::-`      `:/oosNMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ooo+~~``                              ..-:///:++::           /oooo/ooo+-.- `.+ooosmMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooo..                                  ``` `/so-        `:oyooooooooooo++oooodNMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooo/o-``       `           `         `    .    +os+:.```.:+oooooooooooooooooosmMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooo+:`      -+`       ` `                   -::~~/ooosoooooooooo++ooooooooymMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo+.`  `-+:-````````                     :`     `.+:/+oooooooooooooooodMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo~~``  .+/++o+:/+/:.``````  `           `        -::/ooooooooooo+ooodMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo+:.`   /+oooo++oshhhysooo++++//+//:/:::-.```.~~-++-/ooooooooooo/oymMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooooo/:-`  :++oo/-`.+osshmmmmh-.~~~~:://++++o+/+oysssssysyoooooo+oooyNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--soooooooo+:.-``:o+-.    /ooooosyyhho:..      ```.-:/yhsssssysooooooooosmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--dysosoooooo/o+:/o/``    /ooooooooosssoo/:...-...-+ooooooooooooooooooohNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--Nmyososoooooo+ooo+:``   `:ooooooo+/oooooooooooooooooooooooooooooooosdMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMNdyosooooooo+++o+:-     -oooooo/..-/+ooooo+:+ooo+oooooooooooooosyNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMNmhsyssoooooooooo/.   .` .ooooooo/-`.~~/oo:~~/+oooooooooooooossNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMmdddNhhsooooooo+/-`  `  /oooooooo+///+oo+o+oooooo+ooooooossmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--NMMMMNNNMNhssoooooooo+/::- ``.:+ooooooooooooooooooooooooooooshmMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--sdMMMMMMMMMdhoooooooo+/:/-     `-/oooooooooooooo+/o/o+ooooosmMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ooymMMMMMMMMmdhosooo+/:`:~~ .    .::/:::::/+++oo///:+ooooosdNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNNNNNddy-->
<!--oooshNMMMMMMMMmysooo/-/..`` `               ``+oooo+oooosshMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMNNmNNmmmmNN-->
<!--oooooshNMMMMMMMNysoo++/:.`.````              `/+oooooooyssNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooymMMMMMMMNsso+++/~~:.~~                :/oooooosyyNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooooyNMMMNMMhy+++/-`.``-`` `             ..oooshhshmMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--oooooooo+osdNMMMMMdsooo/:-`:::-.   `       `-.-+oosmmMddMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooooooo+sdMMMMNdso++/-://o+/-..  . `:::/+:/oosydNMMNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--ooooooooooooooyNMMMMNysoo/++/+oooo/~~:-+ooooooosshmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--y-+ooooooooooooohmMMMMmddsso+oo+o+oooooo+osooshhNNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--Mh:+ooooooooooooooydNMMMMNmhddhdhdhhhyshyhNdmNMMNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMs/ooo+/++/ooooooooyhmNNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMdo//` `-:/+ooooooooooosyhhddddmmmmmmmmNMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMNd:```~~~~o+/oooooooo+ooooooooo+oooymMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMs.`.-:-:/:/:++:./+o-:/++:://oosmMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMd/```../- .`  `-.  ..`    -hMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMhy-//+-          `     -mMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMh:/.`-`              +NMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMNs-`             oMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMN+           oMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
<!--MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM-->
  </head>
  <body>
    <div id="main_page_two">
      <div id="top_title">Visualize clusters of genes based on homology</div>
      <div id="output_title">OUTPUT</div>
      <div id="graphic_output">  
        <div id="in_title">FILETITLEgtt<br>FILEEVALUEgtt</div>
        <div id="graph_row">
          <div id="graph_image" class="tcell"><img src="123abcd.png" class="graph_image_img"></div>
          <div id="legend_image" class="tcell"><img src="123abcd.png.legend.png" class="legend_image_img"></div>
        </div>
      </div>
      <div id="downloads">
        <div id="download_tile">Download files</div>
        <div id="fasta_file" class="file_link"><a href="123abcd.fasta">Fasta file</a></div>
        <div id="blast_file" class="file_link"><a href="123abcd.result">Blast search results</a></div>
        <div id="dot_file" class="file_link"><a href="123abcd.dot">Dot format network file</a></div>
        <div id="image_file" class="file_link"><a href="123abcd.png">Image file</a></div>
        <div id="legend_file" class="file_link"><a href="123abcd.png.legend.png">Legend image file</a></div>
        <div class="file_link"><a href="123abcd.svg">Labeled SVG image file</a></div>
        If MCL-HMM generator is on:
        <div class="file_link"><a href="123abcd-fasta.zip">MCL grouped fasta files</a></div>
        <div class="file_link"><a href="123abcd-selex.zip">MCL grouped alignment files</a></div>
        <div class="file_link"><a href="123abcd-hmm.zip">MCL groups as hidden markov models</a></div>
      </div>
      <div id="reference">Jason Weirather, Mary Wilson, John Donelson.  Manuscript in preparation 2010.</div>
    </div>
  </div>
  </body>
</html> 

